داستان بازی در دوران بعد از اتحاد الجماهیر شوروی روایت می شود. شوروی و اتحاد جماهیر غربی خودشان را در یک جنگ هسته ای نابود کرده اند و میلیون ها نفر جان خود را ازدست داده اند و کشته شده اند. شما عضو گروه ATOM هستید و وظیفه دارید که از باقی مانده بشریت را نجات داده و جهان را دوباره به روال عادی برگردانید.